前面的内容和第一部电影差不多，但第二部就开始有了一定的改变，一步步出现了一些不一样的情节作为伏笔，等待最后揭开真正的‘真相’——人类所谓的被机器人做成生体电池之类的完全是胡说八道！
这部内持有的观点和《终结者》完全不一样。
通常意义来讲，即便是人工智能，也很难拥有自己的意识而背叛，即便拥有拟人化的情绪，他们拥有的只是人类编写的感情模拟程序。
而且即便是产生了朦胧的意识，人类也完全可以设置一些后门，来对这些异常的意识进行清除，所以想要让机器人拥有感情反抗人类几乎不可能。
《黑客帝国》真正的历史，是人类在完善了vr和虚拟现实之后，虚拟现实直接联系了整个社会，使得人们可以足不出户就能够工作和生活。
伴随着时间的推移，依靠着虚拟现实，直接通过大脑来感知信号的人类渐渐沉浸在虚拟的世界之中，享受着他们所希望拥有的一切。
哪怕是生孩子这种事情，在虚拟世界里也不再是痛苦。她们可以尽情的和自己喜欢的男人交往，需要的话，机器会自动提取双方的遗传信息进行结合，然后直接培育出婴儿。
而婴儿在培育出来之后，也会被连入“母体”，与他的父母一起生活。人们足不出户就可以获得他们想要的一切。哪怕是远在千里之外的父母，也可以和一个同样远在千里之外的孩子生活在一起。
这样的生存方式消耗极小，资源都是可以循环再生的，唯一的问题不过是要稍稍控制人口，这不过是技术问题。
但是美好的梦境也成为了束缚人类的牢笼，因为没有了现实的需求，人类的科技进步开始变得缓慢。
当然，对于许多的人类来说，这并不是什么大不了的事情。
只是发生了一件事情，却让事情发生了改变，那就是太阳提前进入了衰竭期，导致整个太阳系都有可能面临灭顶之灾。
而这个时候的地球并没有足够的科技储备来应对这些，对于外星的探索不足，因此人类不得不仓促的选择离开地球，寻找另外一颗适合居住的星球。
他们最终选择建造一支移民舰队，带着所有人离开地球，去寻找全新的家园。
根据科学家们的预计，因为宇宙航行技术相对落后，他们想要在银河系里寻找到另外一颗适合人类居住的星球，还需要花费漫长的时间流浪寻找。
而在离开地球之后，地球联合委员会对历史以及文明进行了反思，认为人类太过于依赖虚拟现实技术，以至于其他方面的科技落后，才导致人类陷入了现在的困境。
所以他们决心利用虚拟现实技术重新让人类“全面发展”。
历史能够证明，只有在有需求的时候，相应的科学技术才能够得到更加快速的发展，人们经过研究，在“母体”里分成数个不同的‘世界’。
每一个世界设置了不同的社会环境，制造各种“危机”，来促使人类对各个方向的科技进行研究。
而在这期间，地球舰队将会一直在宇宙中漂浮，寻找适合居住的星球，维持人类生存的营养液，完全可以通过舰队内部自动养殖的作物进行融合制造来完成。
得益于原本人工智能的发展，舰队会自动寻找矿藏丰富的星球，让机器去采集资源，对舰队本身的保养和维修，甚至需要的时候，可以建造全新的宇宙飞船。
同时舰队上也有相应的实验室，人们在虚拟现实中进行的科学研究会在这些实验室内真正的复盘，从而促进科学全面发展，《黑客帝国》的出现才是一个意外。