勇卫营拔营以后，浩浩荡荡开进了南京城，占据南三处军营，将原本这四处军营的驻军都赶了出来。
城南那个地方，还不只是驻军在那里，乱得很，城内的明军可以分为两种，一是驻于城北的巡防军，一就是驻于城南的常备军。
简单说来，现下驻扎在南京城南的大致可分为两类。
一类是军营。
如南门边上边营、南营、东营，就是被勇卫营入城后占据的，为永乐一朝设置，常驻此地，是南京的常备军之一。
这三营常备军，不负责平日里南京城的巡防、轮换，还有缉拿盗贼之事，除非城内起了叛军，或者贼军攻城，否则他们都是不动一步。
如今，边营、南营、东营的兵力，都是南京城内那些勋贵在掌管，泰昌元年魏国公徐宏基上报的在册人数是三营各五万，总计十五万。
朱由校没去过，听说还留下来的人数不多，而且大部分都被勋贵、世家子弟占了名额。
这三营的常备军，要改制一番，把兵权从勋贵手里拿回来。
除却这类常备军和平日的巡防军以外，另外一类即是明初至今匠营的遗存，因当年匠户集中居住，统一管理，有类于驻军。
延续至今，弊端尽显。
三营常备军只驻于城南，这次勇卫营入城，占了他们的驻地，所以尽都迁到城北巡防军的几处空营去了。
至于匠户，则广及南京城中以至城外。
如东门的木匠营，尽是永乐年间调往此处的木匠后人，其分布地点极广，每年又要北上入京做轮班匠。
轮班匠制，还有在中国实行了近四个世纪的匠籍制，都是朱由校下来南京要废除的旧制之一。
当然，旧制的废除，需要新制的约束和替代，才能对当下有积极、正面的影响。
这些，朱由校都想的很清楚。
来南京，就是为了大刀阔斧的改革一番，就算不能让南京变成安全稳定的大后方，也得让这个江南给朝廷创造一些收入。
然后回去，和鞑清开干。
匠籍制度的特点就是，但凡入了匠籍的匠户，都被称作军匠，世代不能离开驻地。
一人脱离，全家连坐。
只要入了匠籍，除非当朝的皇帝另有旨意，大力改进匠户制度，不然直至明亡，他们都要居住在匠营，不得出入。
南京城外有一条小溪，朱由校入城时还见过。
小溪的西岸驻扎着不少匠营，其中有个棉甲营，永乐年始置，延续至今，为军队制作棉衣、甲胄、棉鞋的作坊，也都分布在棉甲营驻地的两侧。
每年，棉甲营都要将新制作好的棉甲和鸳鸯棉衣，经漕运送抵九边及辽东，给边军更换甲胄及防具。
军器司自天启元年以来，在天津卫、登莱港，都设置了不少作坊，虽然烧银子，但作用已经越来越大。
截止天启二年十月底，兵部上奏，九边驻军的盔甲和制式刀枪，已经全部完成新旧交替，熊廷弼也受到了三批次的新制遂发鸟枪、火炮。
在天津港的军器司作坊，正对澎湖之战缴获的荷兰战舰、火炮进行研究，不日就能把人家的先进武器，仿制出来安装到自己的水师上。
南京这些老旧的匠营，虽然现在看起来没什么用处，但却都是上好的“军工厂”底子，只要稍加改制，就能把他们变成朝廷军器司下属的一个个工厂，发挥该有的作用。
会更烧钱，但是朱由校已经有了应对之法。
三年前加增沿河关税，为朝廷每年带来了几十万两的收入，那是个试探，到如今，该进行商税改革了。