庆长十七年1612年，以心崇传奉家康之命协助京都所司代板仓胜重，一同担当宗教行政的事务。
翌庆长十八年，以心崇传替幕府撰写了伴天连追放之文。文中规定了幕府对于天皇的本分、五摄家及三公的席次之任命和罢免，以及改元、刑罚、寺院僧侣的职位升调等规则对朝廷和大名进行立法限制。
同时编写了对公家诸法度和专门管理寺院的寺院法度、并编制了面向诸侯门关于筑城、婚姻、参勤交代、造船、关所等规定的武家诸法度。
由此可见，以心崇传为德川幕府编制出了统治天下的所需要的法度，为德川幕府统治天下了合法性的支撑，甚至可以说他是德川幕府背后的影子操控者。
由此可见，以心崇传此人能力和业务水平绝对是没有问题的，但是后世对他的人品褒贬不一。
甚至有人说，他能得到德川家的信任，多是因为其甘愿成为德川家狗腿子，为德川家鞍前马后的原因。
这里举两个例子:
在关源合战后的十几年中，丰臣家逐渐认清了事实，想要学当初的织田家一样，慢慢从德川幕府的体系内淡化自己的存在。
可是盘踞大阪城中的丰臣家此时还掌握着摄津、河内、和泉三国65万石左右的领地。
这些领地距离京都所在的山城国太近，有比邻日本经济城市堺町，独特的地理位置使得丰臣家的综合实力一直都没有得到削弱。
再加上如福岛正则、加藤清正、浅野幸长等与丰臣家亲厚的大名，或念着丰臣家的恩德，或出于对丰臣家的愧疚，保持着与丰臣家的亲善关系。
极好的地理位置，富饶的经济收入，以及在大名之间极高的影响力，使得德川家康对于已经服软的丰臣家依然如芒在背。
真当是匹夫无罪，怀璧其罪。
于是在天正十六1611年年时，德川家康以修复因大地震而毁坏方广寺大佛殿的为名义，要求丰臣家出自修复寺庙。
在修复寺庙之时，铸造铜钟是第一件非常庄重的事情，钟上需要用汉、梵两种语言刻录铭文。丰臣家的人自然不懂梵文，此事自然是交由僧侣负责。
在钟铸好之后以心崇传借着梵钟铭文上“国家安康，君臣丰乐”的字句发挥，指称是要诅咒腰斩家康、并祈求丰臣家繁荣。
时以心崇传还联合五山的许多名僧及藤原惺窝的门人朱子学家林罗山一同对丰臣家指控。终于以丰臣家诅咒家康的名义开战，导致最后丰臣家的灭亡。
要知道以心崇传早年游历诸国的时候，可是受到丰臣秀长的资助的，接过转头就成了灭亡恩公家族的直接推手。
宽永六年1629年，更是爆发了“紫衣事件”。
紫衣是朝廷赐予佛教高僧最高登记的认可，这也是德川幕府时期天皇朝廷为数不多的权利，此前也都是由朝廷自言而决，幕府从没有施加干涉。
事情的发生其实非常的小，后水尾天皇为了朝廷财政问题，允许京都大德寺和妙心寺僧侣数十人穿紫衣。
当然，如过去一样，事先未同幕府商量。
但是由于此前在德川家女子入局天皇家血脉的问题上与朝廷没有谈拢。