而另一方面，由于之前的习惯，很多地方上的包税人和官商，都是让科普特人，以及犹太人、意大利人之类的异教徒和外族来担任的。因此，谢赫政权里，现在充斥着大批这种跑路南下的人。他们南渡之后，在苏丹政权里，甚至具有人数优势。
谢赫政权的一部分坚定支持者，是那些严格反对异教徒的教士。但目前这个情况，科普特人的地位，反而提高了。谢赫和他手下的埃米尔们，也对这些大金主言听计从，给足了面子。这样一来，教士们就很尴尬：大伙就是为了反对异教徒执政，才投奔你来的。结果你这边，还是一堆异教徒在执政。那费这么大力气跑过来，到底是为了什么啊？
不过这个时候，罗马方面也在抓紧时间进行各种民政工作，同样没有精力继续进攻。局势稳定之后，郭康宣布，因为急缺人员，因此准备打破之前上千年的习惯，开始招募有能力的本地人，充任基层管理工作。并且保证，如果有政绩，还可以继续进行提升。
这之后，大批当地人都对罗马政权转变了态度。乡间的“费拉”，还有城里的商人、工匠，乃至一些基层教士，都选择了加入行省政府，谋个职位。
朝廷派来的官吏，数量很有限。郭康为了预备对付瘟疫，又大幅扩充行政编制，不断培训人员，以求进行更细致的管理。军团能提供的人手，都很不够用。中下层的大部分岗位，几乎都被这些人填充了。
因此，行省以下，各级衙门里，充满了埃及本地的天方教信徒。这又引起了传统的“文官集团”，也就是科普特人和一些天方教外来族群的不满。
到后来，罗马这边的天方教徒和苏丹政权的科普特教徒，天天隔空对骂。两边都在指责对方讨好异教徒，迫害教友。不过最后，也没吵出来什么。
瘟疫的到来，结束了这种混乱的对峙局面。
发现郭康这边在进行防备之后，谢赫等人也感觉到了不对劲。开罗人口众多，这些大规模的人员搬迁和卫生清理工作，不可能瞒得过其他人。临战的时候，还花心思搞这么大动静，明显就不对劲。
再加上，春夏时节，本来就是黑死病多发的时候。因此，虽然不相信他们能战胜瘟疫，谢赫也多了个心眼，开始试图模仿罗马方面的各种政策，尤其是其中那些比较简单，而且看起来应该有利于对付瘟疫的部分。
然而，苏丹政权在这方面先天不足。当年控制开罗的时候，他们都没法管住囤积居奇的商贩和上下欺瞒的包税人，现在这个情况，就更加不可能贯彻下去了。
谢赫试图把人员进行分流，将几座港口和城市里的闲杂人等搬迁出去。但命令下达之后，他手下的官员很快开始借此牟利。那些和包税人关系好，乐意花钱投献的人，就能留下来；而其他人，则会被故意迁走，丢到城外荒野去做苦工。