徐阶于是先后4次上书详细的防守规划，并且亲自巡视京师的防备情况，这与严嵩的作为形成了鲜明的对比。
在夏言被诬陷致死后，严嵩在朝中已无劲敌，再加上皇帝久不上朝，一切旨意均由严氏父子掌控。严嵩和严世蕃便趁此机会拉帮结派，大搞贪腐，凡有对立之人都会遭到他们的残酷打压。所以徐阶这次出头引来了严嵩的忌恨，处境十分危险。
徐阶为了躲过此劫，便加紧与严嵩的孙辈联姻，才渡过险境。不过此时的徐阶非常清楚，一味的自保终究不是办法，只要严氏父子不倒，他就永远没有出头之日，甚至一不小心就会丢掉性命。
只是迫于严嵩父子的权势，他只能选择在顺从之中寻找机会，否则稍有不慎就会万劫不复。
在此之前，夏言之死就是因为严嵩与大将军仇鸾的合谋。而仇鸾在此事之后不甘心被严嵩制约，便揭发了严氏父子的罪行。
严嵩父子立刻失去了皇帝的信任。此事对于徐阶来说是件好事，但他非常谨慎：如果严嵩就此倒台自然是好，但如若突发其他状况又该如何？所以毅然选择观望。果然，正当严嵩父子相拥而泣之时，仇鸾居然病重而死。
而严嵩父子在朝中的关系错综复杂，很有可能再次翻身。徐阶于是立刻上书指控仇鸾通敌，使其生前的检举全部作废。严嵩脱离了当下危机。经此一事，徐阶和严嵩的关系彻底缓和。
可严嵩不知道的是，这一切只是徐阶获得信任的投名状。徐阶从此依靠绝佳的演技，表面对严氏父子百依百顺，暗中却集结了大批的反严同僚。
终于在1562年，59岁的徐阶迎来了机会。当时有位名叫蓝道行的道士，因为号称善于扶乩而闻名于京师，这里的扶乩大概是指神仙附体。
徐阶于是将其收买并推荐给明世宗。由于明世宗崇尚仙道，所以对蓝道行非常信任，并且奉为座上宾。
明世宗询问蓝道行朝纲不正的原因，蓝道行便立即做法，然后表现出神仙附体的状态，写道：“奸臣当道，贤臣不能得到重用，而奸臣就是严嵩和严世蕃父子。忠臣就是徐阶。”
其实明世宗对于此话半信半疑，但蓝道行接着写出：“今日有奸臣奏事。”结果刚过不久，严世蕃就入朝。
明世宗立刻相信这是神仙的意思。当然，这一切都是徐阶的安排。徐阶随即连夜让人弹劾严氏父子。
明世宗在次日看到了弹劾奏章，立刻下旨严查严嵩之事，严世蕃及其爪牙全部流放。
按照世宗的意思，严嵩只是体面地退休，所以严嵩并未伤筋动骨。
即使已经82岁，基本没有了翻身的机会，但他在朝廷的势力盘根错节，他的儿子严世蕃依然有着东山再起的可能性。果然，严世蕃在刘芳的帮助下半路返回了老家，并在当地召集人马准备翻盘。
不过，曾经弹劾严世蕃的御史林润得到了消息，他担心严家重新上台，便再次上书指控严世蕃聚众谋反。
历代皇帝对于谋反之事非常敏感，沉迷仙道的明世宗也不例外，于是派人立刻捉拿。
可是严世蕃被捕之时并不惊慌。之前沈炼和杨继盛等人因为弹劾严氏父子被迫害致死。
所以严世蕃被捕之后，他的亲信收买了三法司，希望三部官员在定案文书当中多多提及为杨继盛等人平反昭雪，然后以此名义给他定罪。
之后徐阶召见三部官员，他的眼光非常犀利，立刻发现了定案文书的猫腻。而且只要皇帝看到严世蕃必然无罪。
因为杨继盛等人全部是由明世宗下旨处死，如果着重提及杀掉严世蕃是为了平反昭雪，那就代表皇帝犯错，冤杀大臣。