在蓝染事件终于告一段落之后，仙太郎和清音陪伴着浮竹队长，静静地站在门外，聆听着总队长对三位队长的严厉训斥。
尽管总队长的训斥声如雷霆般响亮，但仙太郎却不禁感慨总队长的精神依然如此矍铄。
在死神代行消失篇中，露琪亚担任了副队长一职。对于这个突如其来的转变，仙太郎心中虽然有些许不满，但他还是选择相信浮竹队长的决定，并与清音一起全力辅助露琪亚。
然而，对于不习惯成为副队长的露琪亚，仙太郎并没有像清音那样改口称呼她为"副队长"，而是依然直接以"朽木"的姓氏来称呼她。
在黑崎一护与银城空吾激烈战斗之后，终于迎来了胜利的曙光。一护虽然身负重伤，但他坚强地挺了过来。而清音则一直守候在一护身旁，见证了他的勇敢和坚韧。
当一护逐渐恢复意识时，清音松了一口气，并决定与一护一同前往浮竹那里，向他报告一护平安无事的消息。
在前往浮竹的路上，他们注意到了一股巨大的青色火焰正在熊熊燃烧。这股火焰显然是由无形帝国的入侵所引发的，它的规模之大令人震惊。
朽木露琪亚看到这一幕后，立刻意识到敌军干部级的人物很可能就在这火柱之下。她毫不犹豫地决定立刻赶往火柱处，一探究竟。
在露琪亚离开后，仙太郎与清音对视了一眼，他们都感受到了局势的紧迫。于是，两人也紧跟着露琪亚，一同奔向那巨大的青色火焰。
在无形帝国的第二次进攻中，仙太郎与清音亲眼目睹了瀞灵廷的剧变。整个灵廷都被火焰和硝烟所笼罩，建筑崩塌，街道混乱不堪。
他们迅速向浮竹通报了袭击的情况，浮竹得知后，决定立刻采取行动。
次日，仙太郎与清音跟随浮竹来到了浦原喜助的实验室。在这里，浮竹开始治疗受伤的队员们，而仙太郎则在一旁吹嘘拍马，试图让气氛轻松一些。
然而，就在这时，一个惊人的消息传来——灵王身死，尸魂界即将崩溃！这个消息如同晴天霹雳，让所有人都震惊不已。
在这关键时刻，仙太郎目睹了浮竹发动神卦，以自己的生命为代价，试图挽救尸魂界。浮竹的身体在光芒中渐渐消散，最终倒在了地上。
仙太郎和清音见状，心急如焚，他们担心地冲向浮竹，希望能做点什么来拯救他。
与其他幸存的死神们一同射杀灭却师的那些散兵游勇们，他们在这场激烈的战斗中各自为战，没有明确的组织和指挥。然而，尽管如此，他们依然勇敢地与强大的灭却师展开殊死搏斗。
在朽木露琪亚任职十三番队队长的仪式上，这位神秘的死神并未露面。这引起了许多人的猜测和议论，但具体原因不得而知。不过，根据作者在jet访谈中的透露，他虽然没有出席仪式，但仍然会继承海燕与浮竹的遗志，全心全意地辅佐露琪亚，成为她的得力助手。