左宗棠在同治四年至五年间的两年里调集各路人马，基本剿灭了福建境内的太平军残部。
左宗棠在鸦片战争时期就认识到西方坚船利炮的巨大威力。
左宗棠在与洋枪队的协同作战中，他更是充分认识到了西洋武器的威力。
因此他积极参与洋务运动，创办了不少军事企业、机构。
左宗棠十分重视新式战舰在海战、河流作战中的作用。
在与太平军作战间隙左宗棠就命人在杭州仿制了一艘小轮船。
“在与太平军的战事结束后，左宗棠将精力投入到加强海防，抵御外敌上。”
“1866年左宗棠抵达福州，当年便向清廷奏请创办福州船政局，并很快得到了朝廷的同意。””
“一年后，福州船政局开工。”
“1866年西北战事趋紧，清廷急调左宗棠赴陕甘，平定回民起义与捻军。”
“左宗棠一直关注福州船政局的建设，其发展一直为左宗棠遥控指挥。”
“在左宗棠的领导下，福州船政局逐渐发展起来，先后建成军舰34艘，具备自行设计建造军舰的能力。”
“同治五年清廷令左宗棠出任陕甘总督，平定西北战乱。”
“就任后左宗棠分析了西北局势，他认为应该先消灭捻军，后平定回民起义。”
“因为捻军战斗力更强，对于清廷威胁也更大。”
“进入陕西后，左宗棠初战失利。”
“左宗棠原定计划包围消灭捻军，而作战灵活的捻军粉碎了左宗棠的包围圈。”
“捻军连克安塞、绥德等地。”
“同治六年十一月捻军兵锋直达保定，威胁清朝统治中心。”
“清廷朝野震动，左宗棠因作战不利被夺职。”
“捻军虽然未被歼灭，但从河南转战陕西、河北等地，未能建立根据地，反而出现了孤军深入，缺乏后勤补给和兵源的致命弱点。”
“左宗棠针对捻军孤军深入，而无后援的死穴，对捻军采取画河圈地，不断缩小包围圈的策略。”
“最后将捻军消灭于徒骇河边。左宗棠因消灭捻军而受到“觐见天颜”的机会，他进入北京紫禁城觐见慈禧太后，并得到了慈禧太后的褒奖。”
“在消灭捻军后，左宗棠回到西安，全力对付回民起义。”
“左宗棠先是通过“剿抚并举”的手段先收伏了回民起义军董福祥部。”
“后攻下董志原，逼迫回民起义军撤往金积堡。”
“1868年5月左宗棠兵分三路，进攻甘肃的回民起义军。”
“战事持续一年半，尤以金积堡的战斗最为激烈，左宗棠所部大将刘松山在战斗中阵亡。”
“在左宗棠的围攻下，回民起义军最终支撑不住，在同治九年十一月年向清军投降。”
“左宗棠接受回民起义军首领马化龙的投降，左宗棠在其召回各地回军后，将马化龙及其全家杀死。”
“左宗棠在此后又继续进攻河州。西宁等地的回民起义军。”