蓝染叛逃前夕，局势紧张到了极点。不久之后，护廷十三队部分队长毅然决定进入虚圈，与蓝染及其手下展开一场生死较量。他们勇敢地面对十刃的强大力量，毫不退缩，最终成功击败了部分十刃，展现出了非凡的战斗技巧和顽强的斗志。
与此同时，其余队员并没有袖手旁观，他们与假面军势紧密合作，在复制的空座町与蓝染、市丸银、东仙要以及前三十刃展开了一场惊心动魄的对决。这场战斗异常激烈，双方都使出了浑身解数，互不相让。
在激烈的战斗中，队长们与十刃展开了殊死搏斗。经过一番鏖战，队长们大多以微弱的优势险胜对手。然而，就在他们稍作喘息之时，蓝染却突然展现出了他的真正实力——“镜花水月”。
凭借这一强大的能力，蓝染以一己之力重创了护廷十三队，让他们陷入了前所未有的困境。而山本元柳斋重国这位德高望重的队长，在战斗中不幸被蓝染陷害，身负重伤。
蓝染与崩玉的融合，使他获得了超越死神与虚的力量，这让他变得更加强大且难以战胜。但就在众人都认为局势已经无法挽回的时候，黑崎一护挺身而出。
为了击败蓝染，黑崎一护不惜放弃自己的死神之力，以一种决绝的方式与蓝染展开了最终对决。在这场惊心动魄的战斗中，黑崎一护凭借着顽强的意志和不屈的精神，最终战胜了蓝染，将他逮捕并监禁起来。
空座町大战落下帷幕后的17个月，护廷十三队并没有停止前进的脚步。他们利用自身的灵压，协助浦原喜助制作了一把能够帮助黑崎一护恢复死神力量的灵刀。在大家的共同努力下，黑崎一护终于重新获得了死神之力，再次成为了一名强大的死神。
与此同时，部分护廷十三队成员还前往现世，讨伐了初代死神代理银城空吾及其同伙，维护了现世的和平与安宁。
然而，好景不长，一场更为惨烈的战争——千年血战，正悄然降临。以友哈巴赫为首的无形帝国向瀞灵廷宣战，并率领着灭却师集团对尸魂界发起了猛烈的进攻。护廷十三队在这场突如其来的战争中遭受了惨重的伤亡，面临着前所未有的巨大压力。
友哈巴赫亲自参战，这无疑给整个战局带来了巨大的变数。山本元柳斋重国，这位曾经威震天下的总队长，在与友哈巴赫的激战中不幸战死，这一消息震惊了整个尸魂界。
在山本元柳斋重国牺牲后，京乐春水接替了总队长的位置。他肩负起了领导护廷十三队的重任，同时也面临着前所未有的压力。为了应对友哈巴赫的威胁，护廷十三队的各个成员都开始接受更为严格的训练，以提升自己的实力。
然而，尽管他们付出了巨大的努力，最终还是未能抵挡住友哈巴赫的强大攻势。友哈巴赫成功地登入了灵王宫，这一圣地的沦陷让整个尸魂界陷入了前所未有的危机之中。
灵王宫之战中，友哈巴赫借助黑崎一护之手害死了灵王，并夺走了灵王的力量。这一变故使得局势愈发严峻，护廷十三队不得不与假面军势携手合作，共同进入灵王宫，与友哈巴赫的神赦亲卫队展开一场生死较量。
经过一场惊心动魄的激战，护廷十三队和假面军势最终取得了胜利。然而，友哈巴赫并没有就此罢休，他在瀞灵廷继续与黑崎一护展开最终对决。
最终，黑崎一护以惊人的实力击败了友哈巴赫，结束了这场漫长而残酷的战争。战后，零番队的兵主部一兵卫将友哈巴赫的尸体做成了新的灵王，为尸魂界带来了新的希望。